COVID-19 стал известен в 2019 году, и с тех пор он постоянно мутирует. Сейчас уже известно множество штаммов вируса SARS-CoV-2, вызывающего болезнь, которая проявляется по-разному в зависимости от штамма и вызывает много вопросов у медиков и общественности. Ниже мы ответим на наиболее важные вопросы, связанные с генетическими вариантами коронавируса.

Штаммы - это культуры, выделенные из одного источника в одном месте и в одно время. Такие культуры принадлежат к одному штамму. Однако, если культуры были выделены из одного источника в разное время, они уже принадлежат к разным штаммам. Важно отметить, что это понятие часто путают с видами. Микроорганизмы, принадлежащие к разным штаммам, могут быть одного вида, но при этом они будут отличаться друг от друга.

Хорошим примером является коронавирус. Хотя вирус SARS-CoV-2, вызвавший последнюю пандемию COVID-19, является одним из представителей семейства коронавирусов, который содержит множество штаммов. Различные штаммы SARS-CoV-2 отличаются набором генов, а следовательно, различаются по скорости распространения и клиническим проявлениям инфекционного заболевания. Также следует отметить, что генетическая изменчивость коронавируса позволяет ему формировать устойчивость к иммунной системе и медикаментозным средствам.

Интересно отметить, что вирусы, включая SARS-CoV-2, не являются клетками. Они имеют особую структуру: вирусная частица (вирион), которая окружена капсулой и внешней оболочкой, а внутри капсулы содержится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим вирусом, вследствие чего его геном закодирован в единственной молекулярной цепи рибонуклеиновой кислоты.

Образование штаммов - это результат генных мутаций, когда образующиеся дочерние вирусы немного отличаются от материнских вирионов по генетическим характеристикам. В результате появляются новые штаммы коронавируса, и они могут представлять разную опасность. Таким образом, необходимо соблюдать меры предосторожности, чтобы не подвергаться риску инфицирования.

В соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения, каждый штамм коронавируса SARS-Cov-2 имеет буквенное обозначение на основе греческого алфавита: от альфа до омикрона. Ранее, штаммы коронавируса получали названия, связанные с местом их первого выявления, например, "британский" или "индийский". Такая классификация, однако, несет в себе негативную окраску, связанную с географической привязкой и может вызвать обвинения в адрес всей страны в распространении COVID-19.

С учетом политкорректности, ВОЗ предложила новую номенклатурную классификацию, основанную на греческом алфавите. При этом, старые названия штаммов коронавируса все еще могут использоваться в медицинских исследованиях. Таким образом, к началу 2022 года количество штаммов коронавируса, которые отличаются от первого, китайского варианта, составило 13.

Однако, даже в новой классификации можно обнаружить нюансы. Наиболее известным сейчас является штамм "омикрон". В его названии пропущены буквы ню и кси, которые должны были предшествовать букве омикрон. По мнению экспертов, букву ню пропустили, чтобы не вызывать панику среди жителей англоязычных стран, где слово "new" (англ. новый) звучит так же, как и "ню" (греч. ню). От буквы кси также отказались, поскольку она связана с китайской фамилией Си, которая носится лидером этой страны Си Цзиньпинь. Некоторые источники ранее бездоказательно обвиняли Китай в создании и распространении коронавируса, и ассоциация названия штамма с фамилией главы государства могла бы инициировать антикитайские настроения.

Вирусные штаммы COVID-19, которые считаются опасными, обладают определенными критериями. Во-первых, они характеризуются высокой контагиозностью, что означает их легкую передачу от человека к человеку. Во-вторых, это вирулентные штаммы, способные вызывать патологические изменения в тканях организма. Кроме того, они приводят к тяжелому течению инфекции, что сопровождается высокой вероятностью осложнений и неблагоприятного исхода болезни. Наконец, опасные штаммы коронавируса устойчивы к действию вакцин и лекарств. Все эти критерии использовались ВОЗ при разработке списка штаммов, вызывающих опасения, – VOC (Variants of Concern). В этот список вошли несколько штаммов, включая альфа-, бета-, гамма- и дельта-штаммы коронавируса. А 26 ноября 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес – VOI (Variants of Interest). Если уровень заболеваемости этими вариантами возрастет, то их переведут в категорию VOC. В список VOI в 2021 году вошли несколько штаммов: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Какова опасность дельта-штамма коронавируса?

Новая индийская вариация коронавируса отличается от классической своей высокой инфекционной способностью. Если в случае COVID-19 каждый пациент заражал от 2 до 3 человек, то в случае дельта-штамма этот показатель возрастает до 5-8. Привнесла ли новая форма изменения в клинический характер заболевания? Индивидуальные особенности клинического течения могут играть роль в увеличении количества заражений. Так, высокая температура часто предупреждает о заражении, но в случае дельта-штамма этот симптом может проявиться не сразу, что делает труднее обнаружить источник инфекции.

Количество вирусов в организме с штаммом дельта-плюс значительно выше по сравнению с классическим COVID-19, поэтому выработка антител требует больше времени и усилий. Усложняется лечение и резко растет вероятность госпитализации пациента. Штамм дельта плюс коронавируса, который является новой модификацией, особенно тяжело протекает и грозит значительным угрозам.

Что отличает британский вариант коронавируса от SARS-CoV-2?

Сравнительно с классическим китайским вариантом, симптомы британской коронавирусной инфекции проявляются чаще и с большей степенью выраженности. Например, боль в горле и кашель чаще отмечаются при альфа-штамме. Но утрата обоняния происходит реже - только у 39% пациентов.

Кроме того, вирус на 90% более заразен, а болезнь протекает более тяжело. Частота госпитализации в случае заражения альфа-штаммом выше на 64%, повышая риск неблагоприятного исхода.

Но к счастью, на территории РФ уровень заболеваемости британским штаммом не так высок. В целом, хочется отметить, что на сегодняшний день выделены несколько вариантов коронавируса - альфа, бета, гамма, дельта - и они отличаются друг от друга по структуре и способности заразить человека.

Штамм омикрон: что мы о нем знаем?

В ноябре 2021 года был обнаружен еще один штамм коронавируса, происходящий из Южной Африки. Он быстро распространился по всему миру, вызывая заболеваемость у многих людей. Штамм омикрон очень заразен и ежедневно устанавливает новые рекорды по числу заболевших. В отличие от первоначального COVID-19, который преимущественно поражал пожилых людей и тех, у кого имеются сопутствующие заболевания, новый штамм также инфицирует детей.

Однако, пока нет единого мнения насчет того, насколько тяжело развивается заболевание и какова вероятность плохого исхода. Согласно лабораторным исследованиям, омикрон-штамм реже проникает в легкие, в отличие от первоначального варианта коронавируса, и чаще поражает носоглотку. Именно из этой части тела вирус проще распространяться воздушно-капельным путем, что может быть одной из причин высокой заболеваемости. В то же время, количество смертельных случаев остается на стабильно низком уровне, составляя около 0,1-0,2% от числа заболевших.

Биолог Константин Северинов дал ответы на 10 основных вопросов о штамме омикрон. Источник: https://trends.rbc.ru/.

Как определить, заразился ли человек одним из вариантов коронавируса?

Характеристики каждого штамма вируса уникальны. Так, если человек заразился одним генетическим вариантом, то болезнь может протекать менее тяжело, в то время как при заражении другим вариантом болезнь может протекать в более тяжелой форме. Кроме того, некоторые типы коронавируса воздействуют в основном на пожилых людей, а другие - на людей всех возрастов. При заражении разными штаммами вируса может быть поражена легкие, носоглотка или желудочно-кишечный тракт. Однако, полагаться только на эти особенности штаммов коронавируса не стоит.

Для определения генетического варианта SARS-CoV-2 требуется проведение объективной диагностики и изучение вирусного генома в лабораторных условиях. В таком случае используют метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) методом секвенирования, где определяется последовательность генов в молекулярной цепи. Хотя для этого требуется использование специализированного оборудования, а процедура является довольно простой: берется мазок из носоглотки и ротоглотки, которые могут быть взяты как в медицинском учреждении, так и дома. Результат готов уже через несколько часов, и они являются практически абсолютно достоверными. По этой причине метод ПЦР считается "золотым стандартом" диагностики инфекции COVID-19. Разработана также первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2. Информационный портал о генетике GENETICS предоставляет к этому всю необходимую информацию. URL: https://genetics-info.ru/.

Вопрос о том, сохраняется ли иммунитет у человека после перенесенного коронавируса к другим его штаммам, остается открытым. После первого заражения в крови образуются антитела, которые пытаются уничтожить новые заражения. Однако возможно, что мутировавший коронавирус может плохо связываться с антителами, поэтому иммунная система может уничтожать не все, а лишь некоторые штаммы вируса.

Кроме того, временной фактор тоже имеет огромное значение. Со временем количество циркулирующих антител в крови уменьшается. Это означает, что эффективность защиты от последующих инфекций также может быть разной, в зависимости от времени, когда повторное заражение произошло, состояния иммунитета и вида мутации. В общем, ответ на вопрос о том, сохраняется ли иммунитет после перенесенного коронавируса, не является однозначным.

Фото: freepik.com